Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms