Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms