Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms