Protein–RNA interactions for Protein: P78329

CYP4F2, Phylloquinone omega-hydroxylase CYP4F2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F2P78329 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F2P78329 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CYP4F2P78329 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CYP4F2P78329 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CYP4F2P78329 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CYP4F2P78329 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CYP4F2P78329 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CYP4F2P78329 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CYP4F2P78329 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F2P78329 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F2P78329 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F2P78329 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F2P78329 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F2P78329 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F2P78329 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F2P78329 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F2P78329 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F2P78329 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F2P78329 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F2P78329 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F2P78329 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F2P78329 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F2P78329 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F2P78329 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F2P78329 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F2P78329 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F2P78329 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F2P78329 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F2P78329 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F2P78329 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F2P78329 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F2P78329 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F2P78329 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F2P78329 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F2P78329 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F2P78329 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F2P78329 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F2P78329 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F2P78329 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms