Protein–RNA interactions for Protein: P68104

EEF1A1, Elongation factor 1-alpha 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P68104 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEF1A1P68104 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms