Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP6P59044 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms