Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSCP56915 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSCP56915 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSCP56915 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSCP56915 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GSCP56915 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSCP56915 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSCP56915 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GSCP56915 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSCP56915 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSCP56915 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSCP56915 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GSCP56915 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSCP56915 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GSCP56915 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSCP56915 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSCP56915 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSCP56915 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GSCP56915 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GSCP56915 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GSCP56915 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GSCP56915 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GSCP56915 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GSCP56915 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GSCP56915 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GSCP56915 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GSCP56915 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GSCP56915 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GSCP56915 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
GSCP56915 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSCP56915 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GSCP56915 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSCP56915 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSCP56915 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSCP56915 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSCP56915 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSCP56915 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GSCP56915 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSCP56915 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GSCP56915 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GSCP56915 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GSCP56915 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSCP56915 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSCP56915 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSCP56915 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSCP56915 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSCP56915 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSCP56915 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSCP56915 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSCP56915 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSCP56915 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSCP56915 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSCP56915 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSCP56915 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSCP56915 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSCP56915 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSCP56915 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSCP56915 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSCP56915 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSCP56915 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GSCP56915 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSCP56915 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSCP56915 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GSCP56915 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSCP56915 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GSCP56915 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSCP56915 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GSCP56915 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSCP56915 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSCP56915 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSCP56915 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSCP56915 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSCP56915 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSCP56915 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSCP56915 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSCP56915 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSCP56915 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSCP56915 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSCP56915 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSCP56915 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSCP56915 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSCP56915 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSCP56915 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSCP56915 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSCP56915 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSCP56915 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms