Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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CLDN15P56746 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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CLDN15P56746 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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CLDN15P56746 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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CLDN15P56746 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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