Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms