Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACLYP53396 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACLYP53396 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACLYP53396 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACLYP53396 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACLYP53396 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACLYP53396 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACLYP53396 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACLYP53396 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACLYP53396 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACLYP53396 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACLYP53396 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACLYP53396 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACLYP53396 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ACLYP53396 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACLYP53396 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACLYP53396 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACLYP53396 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACLYP53396 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACLYP53396 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACLYP53396 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACLYP53396 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACLYP53396 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACLYP53396 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACLYP53396 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACLYP53396 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACLYP53396 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACLYP53396 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACLYP53396 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACLYP53396 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACLYP53396 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACLYP53396 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACLYP53396 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACLYP53396 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACLYP53396 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACLYP53396 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACLYP53396 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ACLYP53396 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACLYP53396 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACLYP53396 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACLYP53396 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ACLYP53396 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACLYP53396 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACLYP53396 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACLYP53396 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACLYP53396 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACLYP53396 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACLYP53396 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACLYP53396 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACLYP53396 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACLYP53396 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACLYP53396 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACLYP53396 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACLYP53396 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACLYP53396 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACLYP53396 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACLYP53396 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACLYP53396 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACLYP53396 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACLYP53396 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACLYP53396 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACLYP53396 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACLYP53396 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACLYP53396 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACLYP53396 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACLYP53396 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACLYP53396 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACLYP53396 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACLYP53396 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACLYP53396 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACLYP53396 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACLYP53396 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACLYP53396 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACLYP53396 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACLYP53396 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACLYP53396 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACLYP53396 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACLYP53396 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACLYP53396 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ACLYP53396 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACLYP53396 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACLYP53396 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACLYP53396 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACLYP53396 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ACLYP53396 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACLYP53396 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACLYP53396 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACLYP53396 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACLYP53396 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACLYP53396 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ACLYP53396 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACLYP53396 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACLYP53396 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ACLYP53396 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACLYP53396 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACLYP53396 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACLYP53396 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ACLYP53396 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACLYP53396 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACLYP53396 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms