Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGDP52209 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGDP52209 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGDP52209 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGDP52209 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGDP52209 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGDP52209 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PGDP52209 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGDP52209 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGDP52209 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGDP52209 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGDP52209 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGDP52209 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGDP52209 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGDP52209 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGDP52209 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGDP52209 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGDP52209 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGDP52209 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGDP52209 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGDP52209 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGDP52209 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGDP52209 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGDP52209 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGDP52209 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PGDP52209 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGDP52209 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGDP52209 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGDP52209 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGDP52209 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGDP52209 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGDP52209 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGDP52209 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGDP52209 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGDP52209 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGDP52209 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGDP52209 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGDP52209 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGDP52209 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGDP52209 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGDP52209 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGDP52209 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGDP52209 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGDP52209 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGDP52209 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGDP52209 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGDP52209 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGDP52209 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PGDP52209 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGDP52209 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGDP52209 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGDP52209 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGDP52209 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGDP52209 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGDP52209 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGDP52209 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms