Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GGCXP38435 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GGCXP38435 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GGCXP38435 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GGCXP38435 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GGCXP38435 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
GGCXP38435 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GGCXP38435 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GGCXP38435 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GGCXP38435 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GGCXP38435 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GGCXP38435 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGCXP38435 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGCXP38435 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGCXP38435 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GGCXP38435 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGCXP38435 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGCXP38435 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGCXP38435 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGCXP38435 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGCXP38435 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGCXP38435 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGCXP38435 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGCXP38435 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGCXP38435 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGCXP38435 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGCXP38435 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGCXP38435 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGCXP38435 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGCXP38435 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GGCXP38435 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGCXP38435 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGCXP38435 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGCXP38435 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GGCXP38435 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGCXP38435 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGCXP38435 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGCXP38435 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGCXP38435 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGCXP38435 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGCXP38435 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGCXP38435 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGCXP38435 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGCXP38435 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGCXP38435 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGCXP38435 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GGCXP38435 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GGCXP38435 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GGCXP38435 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GGCXP38435 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GGCXP38435 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms