Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms