Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARGP37231 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARGP37231 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARGP37231 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARGP37231 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARGP37231 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARGP37231 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARGP37231 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARGP37231 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARGP37231 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARGP37231 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARGP37231 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGP37231 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGP37231 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGP37231 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGP37231 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGP37231 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGP37231 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGP37231 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGP37231 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGP37231 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGP37231 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGP37231 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGP37231 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGP37231 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGP37231 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGP37231 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGP37231 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGP37231 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGP37231 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGP37231 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGP37231 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGP37231 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGP37231 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGP37231 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGP37231 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGP37231 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGP37231 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGP37231 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGP37231 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGP37231 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGP37231 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGP37231 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGP37231 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGP37231 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGP37231 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGP37231 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGP37231 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGP37231 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGP37231 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGP37231 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGP37231 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGP37231 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGP37231 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGP37231 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGP37231 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGP37231 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGP37231 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGP37231 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGP37231 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGP37231 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGP37231 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGP37231 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGP37231 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGP37231 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGP37231 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGP37231 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGP37231 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGP37231 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGP37231 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGP37231 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGP37231 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGP37231 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGP37231 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGP37231 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGP37231 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGP37231 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGP37231 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGP37231 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGP37231 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGP37231 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGP37231 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGP37231 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGP37231 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGP37231 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGP37231 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGP37231 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGP37231 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGP37231 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGP37231 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGP37231 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGP37231 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGP37231 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGP37231 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGP37231 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARGP37231 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARGP37231 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARGP37231 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARGP37231 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARGP37231 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms