Protein–RNA interactions for Protein: P29376

LTK, Leukocyte tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTKP29376 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTKP29376 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTKP29376 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTKP29376 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTKP29376 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTKP29376 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTKP29376 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTKP29376 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTKP29376 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTKP29376 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LTKP29376 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTKP29376 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LTKP29376 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTKP29376 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTKP29376 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTKP29376 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTKP29376 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTKP29376 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTKP29376 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTKP29376 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTKP29376 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTKP29376 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTKP29376 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTKP29376 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTKP29376 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTKP29376 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTKP29376 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTKP29376 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTKP29376 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTKP29376 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTKP29376 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTKP29376 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LTKP29376 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTKP29376 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTKP29376 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTKP29376 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LTKP29376 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTKP29376 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTKP29376 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTKP29376 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTKP29376 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTKP29376 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LTKP29376 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTKP29376 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTKP29376 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTKP29376 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTKP29376 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTKP29376 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LTKP29376 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LTKP29376 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTKP29376 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LTKP29376 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LTKP29376 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LTKP29376 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTKP29376 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTKP29376 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LTKP29376 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTKP29376 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTKP29376 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTKP29376 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTKP29376 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTKP29376 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTKP29376 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTKP29376 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTKP29376 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTKP29376 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTKP29376 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTKP29376 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTKP29376 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTKP29376 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTKP29376 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTKP29376 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTKP29376 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTKP29376 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTKP29376 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTKP29376 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTKP29376 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTKP29376 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTKP29376 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LTKP29376 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTKP29376 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTKP29376 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTKP29376 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTKP29376 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LTKP29376 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LTKP29376 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTKP29376 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTKP29376 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTKP29376 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTKP29376 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTKP29376 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTKP29376 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTKP29376 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTKP29376 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTKP29376 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LTKP29376 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTKP29376 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTKP29376 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTKP29376 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTKP29376 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms