Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms