Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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