Protein–RNA interactions for Protein: P27695

APEX1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX1P27695 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APEX1P27695 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APEX1P27695 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APEX1P27695 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APEX1P27695 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APEX1P27695 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APEX1P27695 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APEX1P27695 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APEX1P27695 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APEX1P27695 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APEX1P27695 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APEX1P27695 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APEX1P27695 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APEX1P27695 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APEX1P27695 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APEX1P27695 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APEX1P27695 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APEX1P27695 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APEX1P27695 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APEX1P27695 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APEX1P27695 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APEX1P27695 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APEX1P27695 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APEX1P27695 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APEX1P27695 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APEX1P27695 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APEX1P27695 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APEX1P27695 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APEX1P27695 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APEX1P27695 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APEX1P27695 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APEX1P27695 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APEX1P27695 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APEX1P27695 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APEX1P27695 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APEX1P27695 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APEX1P27695 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APEX1P27695 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APEX1P27695 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APEX1P27695 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APEX1P27695 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APEX1P27695 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APEX1P27695 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APEX1P27695 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APEX1P27695 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APEX1P27695 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APEX1P27695 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APEX1P27695 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APEX1P27695 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APEX1P27695 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APEX1P27695 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APEX1P27695 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APEX1P27695 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APEX1P27695 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APEX1P27695 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APEX1P27695 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APEX1P27695 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APEX1P27695 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APEX1P27695 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APEX1P27695 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APEX1P27695 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APEX1P27695 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms