Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTAFRP25105 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTAFRP25105 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTAFRP25105 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTAFRP25105 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTAFRP25105 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTAFRP25105 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTAFRP25105 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTAFRP25105 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTAFRP25105 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTAFRP25105 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTAFRP25105 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTAFRP25105 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTAFRP25105 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTAFRP25105 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTAFRP25105 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTAFRP25105 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTAFRP25105 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTAFRP25105 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTAFRP25105 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTAFRP25105 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTAFRP25105 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTAFRP25105 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTAFRP25105 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PTAFRP25105 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTAFRP25105 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTAFRP25105 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTAFRP25105 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTAFRP25105 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTAFRP25105 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTAFRP25105 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTAFRP25105 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTAFRP25105 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTAFRP25105 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTAFRP25105 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTAFRP25105 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTAFRP25105 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTAFRP25105 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTAFRP25105 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTAFRP25105 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTAFRP25105 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTAFRP25105 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTAFRP25105 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTAFRP25105 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTAFRP25105 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTAFRP25105 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTAFRP25105 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms