Protein–RNA interactions for Protein: P25024

CXCR1, C-X-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR1P25024 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms