Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPREP23469 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPREP23469 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPREP23469 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPREP23469 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPREP23469 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPREP23469 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPREP23469 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPREP23469 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPREP23469 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPREP23469 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPREP23469 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPREP23469 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPREP23469 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPREP23469 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPREP23469 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPREP23469 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPREP23469 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPREP23469 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPREP23469 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPREP23469 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPREP23469 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPREP23469 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPREP23469 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPREP23469 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPREP23469 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPREP23469 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPREP23469 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPREP23469 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPREP23469 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPREP23469 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPREP23469 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPREP23469 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPREP23469 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPREP23469 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPREP23469 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPREP23469 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPREP23469 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPREP23469 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPREP23469 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPREP23469 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPREP23469 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPREP23469 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPREP23469 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPREP23469 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPREP23469 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPREP23469 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPREP23469 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPREP23469 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPREP23469 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPREP23469 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPREP23469 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPREP23469 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPREP23469 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPREP23469 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPREP23469 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPREP23469 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPREP23469 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPREP23469 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPREP23469 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPREP23469 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPREP23469 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPREP23469 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPREP23469 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPREP23469 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPREP23469 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPREP23469 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPREP23469 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPREP23469 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPREP23469 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPREP23469 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPREP23469 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPREP23469 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPREP23469 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPREP23469 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPREP23469 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPREP23469 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPREP23469 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPREP23469 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPREP23469 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPREP23469 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPREP23469 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPREP23469 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPREP23469 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPREP23469 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPREP23469 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPREP23469 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPREP23469 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPREP23469 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPREP23469 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPREP23469 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPREP23469 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPREP23469 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPREP23469 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPREP23469 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPREP23469 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPREP23469 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPREP23469 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPREP23469 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPREP23469 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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