Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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