Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms