Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLUP10909 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLUP10909 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLUP10909 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLUP10909 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLUP10909 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLUP10909 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLUP10909 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLUP10909 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLUP10909 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLUP10909 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLUP10909 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLUP10909 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLUP10909 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLUP10909 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLUP10909 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLUP10909 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLUP10909 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLUP10909 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLUP10909 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLUP10909 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLUP10909 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLUP10909 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLUP10909 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLUP10909 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLUP10909 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLUP10909 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLUP10909 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLUP10909 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLUP10909 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLUP10909 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLUP10909 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLUP10909 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLUP10909 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLUP10909 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLUP10909 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLUP10909 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLUP10909 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLUP10909 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CLUP10909 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLUP10909 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLUP10909 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLUP10909 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLUP10909 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLUP10909 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLUP10909 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLUP10909 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLUP10909 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLUP10909 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLUP10909 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLUP10909 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLUP10909 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLUP10909 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLUP10909 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLUP10909 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLUP10909 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLUP10909 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLUP10909 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLUP10909 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLUP10909 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLUP10909 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLUP10909 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLUP10909 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLUP10909 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLUP10909 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLUP10909 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLUP10909 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLUP10909 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLUP10909 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLUP10909 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLUP10909 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLUP10909 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLUP10909 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLUP10909 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLUP10909 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLUP10909 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLUP10909 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLUP10909 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLUP10909 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLUP10909 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUP10909 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUP10909 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUP10909 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUP10909 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUP10909 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUP10909 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUP10909 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUP10909 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUP10909 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUP10909 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUP10909 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUP10909 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUP10909 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUP10909 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUP10909 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUP10909 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUP10909 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUP10909 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUP10909 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUP10909 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms