Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HKR1P10072 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HKR1P10072 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HKR1P10072 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HKR1P10072 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HKR1P10072 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HKR1P10072 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HKR1P10072 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HKR1P10072 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HKR1P10072 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HKR1P10072 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HKR1P10072 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HKR1P10072 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HKR1P10072 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HKR1P10072 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HKR1P10072 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HKR1P10072 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HKR1P10072 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HKR1P10072 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HKR1P10072 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HKR1P10072 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HKR1P10072 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HKR1P10072 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HKR1P10072 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HKR1P10072 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HKR1P10072 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HKR1P10072 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HKR1P10072 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HKR1P10072 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HKR1P10072 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HKR1P10072 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HKR1P10072 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HKR1P10072 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HKR1P10072 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HKR1P10072 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HKR1P10072 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HKR1P10072 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HKR1P10072 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HKR1P10072 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HKR1P10072 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HKR1P10072 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HKR1P10072 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HKR1P10072 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HKR1P10072 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HKR1P10072 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HKR1P10072 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HKR1P10072 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HKR1P10072 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HKR1P10072 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HKR1P10072 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HKR1P10072 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HKR1P10072 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HKR1P10072 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HKR1P10072 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HKR1P10072 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms