Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms