Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms