Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSP90AB1P08238 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms