Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINA1P01009 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms