Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms