Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOL3O95236 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOL3O95236 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOL3O95236 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOL3O95236 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOL3O95236 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOL3O95236 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOL3O95236 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOL3O95236 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOL3O95236 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOL3O95236 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOL3O95236 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOL3O95236 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOL3O95236 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOL3O95236 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOL3O95236 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOL3O95236 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOL3O95236 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOL3O95236 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOL3O95236 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOL3O95236 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOL3O95236 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOL3O95236 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOL3O95236 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOL3O95236 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOL3O95236 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOL3O95236 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOL3O95236 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOL3O95236 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOL3O95236 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOL3O95236 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOL3O95236 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOL3O95236 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOL3O95236 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOL3O95236 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOL3O95236 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOL3O95236 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOL3O95236 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOL3O95236 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms