Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms