Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms