Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNJ2O15056 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNJ2O15056 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNJ2O15056 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNJ2O15056 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNJ2O15056 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNJ2O15056 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNJ2O15056 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNJ2O15056 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNJ2O15056 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNJ2O15056 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNJ2O15056 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNJ2O15056 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNJ2O15056 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNJ2O15056 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNJ2O15056 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNJ2O15056 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNJ2O15056 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNJ2O15056 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNJ2O15056 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNJ2O15056 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNJ2O15056 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNJ2O15056 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNJ2O15056 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNJ2O15056 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNJ2O15056 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNJ2O15056 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNJ2O15056 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNJ2O15056 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNJ2O15056 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNJ2O15056 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNJ2O15056 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNJ2O15056 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNJ2O15056 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNJ2O15056 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNJ2O15056 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNJ2O15056 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNJ2O15056 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms