Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
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