Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms