Protein–RNA interactions for Protein: O00421

CCRL2, C-C chemokine receptor-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCRL2O00421 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCRL2O00421 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms