Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms