Protein–RNA interactions for Protein: B4DJY2

TMEM233, Transmembrane protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM233B4DJY2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM233B4DJY2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms