Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF839A8K0R7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms