Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC4A6NH21 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms