Protein–RNA interactions for Protein: W5XKT8

SPACA6, Sperm acrosome membrane-associated protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA6W5XKT8 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPACA6W5XKT8 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPACA6W5XKT8 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms