Protein–RNA interactions for Protein: V9GY05

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY05 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
V9GY05 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
V9GY05 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
V9GY05 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
V9GY05 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
V9GY05 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
V9GY05 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
V9GY05 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
V9GY05 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
V9GY05 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
V9GY05 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
V9GY05 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
V9GY05 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
V9GY05 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
V9GY05 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
V9GY05 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
V9GY05 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
V9GY05 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
V9GY05 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
V9GY05 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
V9GY05 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
V9GY05 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
V9GY05 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
V9GY05 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
V9GY05 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
V9GY05 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
V9GY05 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
V9GY05 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
V9GY05 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
V9GY05 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
V9GY05 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
V9GY05 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
V9GY05 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
V9GY05 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
V9GY05 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
V9GY05 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
V9GY05 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
V9GY05 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
V9GY05 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
V9GY05 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
V9GY05 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
V9GY05 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
V9GY05 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
V9GY05 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
V9GY05 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
V9GY05 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
V9GY05 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
V9GY05 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
V9GY05 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
V9GY05 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
V9GY05 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
V9GY05 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
V9GY05 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
V9GY05 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
V9GY05 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
V9GY05 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
V9GY05 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
V9GY05 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
V9GY05 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
V9GY05 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
V9GY05 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
V9GY05 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
V9GY05 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
V9GY05 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
V9GY05 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
V9GY05 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
V9GY05 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
V9GY05 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
V9GY05 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
V9GY05 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
V9GY05 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
V9GY05 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
V9GY05 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
V9GY05 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
V9GY05 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
V9GY05 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
V9GY05 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
V9GY05 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
V9GY05 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
V9GY05 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
V9GY05 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
V9GY05 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
V9GY05 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
V9GY05 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
V9GY05 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
V9GY05 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
V9GY05 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
V9GY05 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
V9GY05 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
V9GY05 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
V9GY05 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
V9GY05 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
V9GY05 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
V9GY05 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
V9GY05 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
V9GY05 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
V9GY05 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
V9GY05 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
V9GY05 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
V9GY05 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms