Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms