Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms