Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms