Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms