Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms