Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJB4Q9UDY4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms