Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms